RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 KDELR1P24390 212 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SDC4P31431 198 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 IKBKEQ14164 716 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CLUL1Q15846 466 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MARCH5Q9NX47 278 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ERLIN1O75477 346 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GALTP07902 379 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L7P0C7H9 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 DR1Q01658 176 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ACAP1Q15027 740 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CYP1B1Q16678 543 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 IFT20Q8IY31 132 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB106AQ8N104 65 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA18Q8TC71 538 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 NFU1Q9UMS0 254 aa16.08■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DPYSL4O14531 572 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 OAZ2O95190 189 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 KRT7P08729 469 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2F1P24903 491 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CHRNA3P32297 505 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 PCK1P35558 622 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CDKN2BP42772 138 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC4P56524 1084 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ODF2Q5BJF6 829 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD6Q8NC69 237 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FUT8Q9BYC5 575 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DCLK3Q9C098 648 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DPH5Q9H2P9 285 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC19Q9H756 370 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.08■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 E7ENQ6 273 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM153BP0C7A2 387 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CSF2RAP15509 400 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 MCM3P25205 808 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 TSPY1Q01534 308 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 MMRN1Q13201 1228 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM153CQ494X1 144 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 RAB41Q5JT25 222 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 TBCBQ99426 244 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.07■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DAPK3O43293 454 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC3O43617 180 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 TIMP1P01033 207 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 FYNP06241 537 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ACRP10323 421 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 CA9Q16790 459 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF6Q58WW2 860 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 JAMLQ86YT9 394 aa16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CASQ1-201ENST00000368078 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms