RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPDYE2BA6NHP3 402 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 MEI4A8MW99 385 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 BTBD19C9JJ37 291 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 F8VP50 259 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 NFIBO00712 420 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PEX1O43933 1283 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM189A1O60320 539 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CST8O60676 142 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 OPHN1O60890 802 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 DGAT1O75907 488 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 KRT38O76015 456 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 USP1O94782 785 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMCC1O94876 653 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 STBD1O95210 358 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 APOEP02649 317 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 APOC2P02655 101 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PSAPP07602 524 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPDYE6P0CI01 402 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RBP3P10745 1247 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYL4P12829 197 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 UQCRBP14927 111 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 VAV1P15498 845 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 OSBPP22059 807 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 KDELR1P24390 212 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PRKCHP24723 683 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CNTFP26441 200 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PRDX6P30041 224 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCND2P30279 289 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CRHR1P34998 444 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CPOXP36551 454 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CAP2P40123 477 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RGS2P41220 211 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAGEA6P43360 314 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RANBP1P43487 201 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CHN2P52757 468 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 COPAP53621 1224 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 AQP5P55064 265 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 GDF10P55107 478 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 DYNLT1P63172 113 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 BASP1P80723 227 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ARHGAP8P85298 464 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CNTN2Q02246 1040 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 KDSRQ06136 332 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 BTKQ06187 659 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 GRM1Q13255 1194 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 MED21Q13503 144 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 NAB1Q13506 487 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCNIQ14094 377 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 TFDP2Q14188 446 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 DPYSL3Q14195 570 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ACAP1Q15027 740 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PDK3Q15120 406 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 NOMO1Q15155 1222 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SURF1Q15526 300 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPDYE2Q495Y8 402 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 TMEM259Q4ZIN3 620 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SFT2D3Q587I9 215 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 MDH1BQ5I0G3 518 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CFAP157Q5JU67 520 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 POTEAQ6S8J7 498 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 C4orf22Q6V702 233 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RFX8Q6ZV50 586 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAPH1Q70E73 1250 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 ANO5Q75V66 913 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 TAS1R3Q7RTX0 852 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 SPATA24Q86W54 205 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 RASSF3Q86WH2 238 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 NCAPG2Q86XI2 1143 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 WDR49Q8IV35 697 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56.3-201ENST00000363507 IGDCC3Q8IVU1 814 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms