RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HS6ST2Q96MM7 605 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CAMK1GQ96NX5 476 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRMOQ9BU70 441 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ARMT1Q9H993 441 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SNX15Q9NRS6 342 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CNNM1Q9NRU3 951 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP35Q9P2H5 1018 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MED16Q9Y2X0 877 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A0A087WWL8 130 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PMPCBO75439 489 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IL33O95760 270 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 POU2F2P09086 479 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CTSAP10619 480 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TNFRSF1BP20333 461 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MTHFSP49914 203 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HYAL1Q12794 435 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MTX1Q13505 466 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DENND2CQ68D51 928 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RANBP10Q6VN20 620 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP43Q70EL4 1123 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GAS2L3Q86XJ1 694 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPARTQ8N0X7 666 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC15A4Q8N697 577 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MVB12AQ96EY5 273 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRGPRX1Q96LB2 322 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPC25Q9HBM1 224 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 STAP2Q9UGK3 403 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NOTCH4Q99466 2003 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 M0R3H8 397 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRT86O43790 486 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMPRSS11DO60235 418 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ALDH2P05091 517 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TGFB3P10600 412 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MT3P25713 68 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BCAT1P54687 386 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RAB1AP62820 205 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRT81Q14533 505 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VSTM1Q6UX27 236 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MMP21Q8N119 569 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MPP5Q8N3R9 675 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLBD2Q8NHP8 589 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP2R3CQ969Q6 453 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WDYHV1Q96HA8 205 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NLRP4Q96MN2 994 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MLXIPQ9HAP2 919 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ICKQ9UPZ9 632 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C4orf47A7E2U8 309 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPRY2O43597 315 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SRGAP2O75044 1071 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 THP07101 528 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CREB1P16220 341 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EPHA3P29320 983 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRKAR1BP31321 381 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CPA2P48052 419 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC14A1Q13336 389 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCNIQ14094 377 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MFSD13AQ14CX5 517 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF628Q5EBL2 1059 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM240Q5SV17 173 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF783Q6ZMS7 281 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HSPBAP1Q96EW2 488 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF479Q96JC4 524 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAP3K14Q99558 947 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CGRRF1Q99675 332 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZPBPQ9BS86 351 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VN1R3Q9BXE9 311 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRIM54Q9BYV2 358 aa2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms