RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPN22-201ENST00000359785 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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