RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352127.11

XRCC3-201, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC3, Length 2,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-201ENST00000352127 UGT1A9O60656 530 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 LGR5O75473 907 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PYGBP11216 843 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 LONP2Q86WA8 852 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF570Q96NI8 536 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 UGT1A7Q9HAW7 530 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.49■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 H0Y3Z8 333 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 KCNN4O15554 427 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ZWINTO95229 277 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 HMGCRP04035 888 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 NETO2Q8NC67 525 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 EFR3BQ9Y2G0 817 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 LPXNO60711 386 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 MT-ND3P03897 115 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 INSRRP14616 1297 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 BGNP21810 368 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 RBL1P28749 1068 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 SLC18A1P54219 525 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 FAM13CQ8NE31 585 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TTC8Q8TAM2 541 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 MECRQ9BV79 373 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 LRMDAQ9H2I8 198 aa18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 LRRC37A2A6NM11 1700 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PPEF2O14830 753 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 GPD1P21695 349 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ALDH3A1P30838 453 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 NOMO1Q15155 1222 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ILDR2Q71H61 639 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PPM1NQ8N819 430 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 MANSC1Q9H8J5 431 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 AKT3Q9Y243 479 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 C2CD4BA6NLJ0 364 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 C22orf31O95567 290 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PFKMP08237 780 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 NEFHP12036 1026 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CCND1P24385 295 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 IL4RP24394 825 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 BMPR2Q13873 1038 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 KCNJ11Q14654 390 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 RSAD1Q9HA92 442 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ASNSD1Q9NWL6 643 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.47■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 DCTN3O75935 186 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF286BP0CG31 522 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 KRT81Q14533 505 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 NAA25Q14CX7 972 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 AMHR2Q16671 573 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PMF1Q6P1K2 205 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 RFWD3Q6PCD5 774 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TTC7BQ86TV6 843 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 SCUBE3Q8IX30 993 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CYTH2Q99418 400 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 USP29Q9HBJ7 922 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 WDR35Q9P2L0 1181 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 GINS2Q9Y248 185 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CSADQ9Y600 493 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 SCN1AP35498 2009 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 CFAP69A5D8W1 941 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 PRPSAP2O60256 369 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 ENTPD5O75356 428 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 MIPEPQ99797 713 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 MIS12Q9H081 205 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 HEY2Q9UBP5 337 aa18.46■□□□□ 0.55
XRCC3-201ENST00000352127 IL18RAPO95256 599 aa18.45■□□□□ 0.54
XRCC3-201ENST00000352127 APRTP07741 180 aa18.45■□□□□ 0.54
XRCC3-201ENST00000352127 INHBAP08476 426 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms