RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 NDUFV1P49821 464 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CNGA2Q16280 664 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 HUS1O60921 280 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 YY1P25490 414 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MAN1A1P33908 653 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 DCAF6Q58WW2 860 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC63Q8NA47 563 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC77Q9BR77 488 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 KPNA7A9QM74 516 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TRAPPC3O43617 180 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 STX2P32856 288 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 BCAR1P56945 870 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 WSCD1Q658N2 575 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 APRTP07741 180 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PAEPP09466 180 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PSEN1P49768 467 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 APPL2Q8NEU8 664 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 NRCAMQ92823 1304 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MGAMO43451 1857 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 GPR32O75388 356 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ELNP15502 786 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 GRM5P41594 1212 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 HIF1AQ16665 826 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 NME8Q8N427 588 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 STKLD1Q8NE28 680 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 FAF2Q96CS3 445 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 IPPQ9Y573 584 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 GHRP10912 638 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MAP3K7CLP57077 242 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ADIGQ0VDE8 80 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MSS51Q4VC12 460 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CASC4Q6P4E1 433 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 FAM228AQ86W67 206 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ALLCQ8N6M5 410 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CCNYQ8ND76 341 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MIEF2Q96C03 454 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MCM8Q9UJA3 840 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 M0QZ92 97 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 GBP1P32455 592 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CRHR2Q13324 411 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PPP2R5DQ14738 602 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC78A2IDD5 438 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 A6NJR5 290 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 CAPN9O14815 690 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 UPP2O95045 317 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 ZBED1O96006 694 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 NUDT17P0C025 328 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM4-201ENST00000349062 THPOP40225 353 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 365.7 ms