RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 EOGTQ5NDL2 527 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 VSTM1Q6UX27 236 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RFX6Q8HWS3 928 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD6Q8NC69 237 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM209Q96SK2 561 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC31A1O15431 190 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CYP26A1O43174 497 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 TPI1P60174 286 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ADIGQ0VDE8 80 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MTF1Q14872 753 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BSNDQ8WZ55 320 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 IFT43Q96FT9 208 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TSNARE1Q96NA8 513 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 IL12RB2Q99665 862 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 LRRD1A4D1F6 860 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC72A6NJI9 287 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 PRCPP42785 496 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RTP2Q5QGT7 225 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FOXQ1Q9C009 403 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK12Q9HB15 430 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 KRIT1O00522 736 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 TBL1XO60907 577 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 VDRP11473 427 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RHOAP61586 193 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAM193AP78312 1265 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CYP24A1Q07973 514 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC14Q49A88 953 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.64□□□□□ -1.67
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