RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GUA9 196 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 C2CD2LO14523 706 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 KCNN4O15554 427 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 GNAZP19086 355 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 YY1P25490 414 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 SERPINB3P29508 390 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 ERFP50548 548 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 SLC18A1P54219 525 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 VGLL4Q14135 290 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 CA9Q16790 459 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 CES4AQ5XG92 561 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 METTL7BQ6UX53 244 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 RFX8Q6ZV50 586 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 RPAINQ86UA6 219 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 PPM1NQ8N819 430 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 TTC13Q8NBP0 860 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 NETO2Q8NC67 525 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 CHST13Q8NET6 341 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-202ENST00000342084 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 ANK1P16157 1881 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ACKR2O00590 384 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SOCS7O14512 581 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MED7O43513 233 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 HCRTO43612 131 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 B4GALT4O60513 344 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CILPO75339 1184 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 WFS1O76024 890 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RNF8O76064 485 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 HMGCRP04035 888 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 INHBAP08476 426 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 STAG3L1P0CL83 205 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TPBGLP0DKB5 382 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PDGFRAP16234 1089 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 GPD1P21695 349 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 EDNRBP24530 442 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RBL1P28749 1068 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 GPD2P43304 727 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 BAG6P46379 1132 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NEK3P51956 506 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NDST1P52848 882 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KRT81Q14533 505 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KCNJ11Q14654 390 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NOMO1Q15155 1222 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RINLQ6ZS11 566 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MPP5Q8N3R9 675 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 INPP5DQ92835 1189 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 APOPT1Q96IL0 206 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SPATA33Q96N06 139 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CYTH2Q99418 400 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 LHX5Q9H2C1 402 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KCNK13Q9HB14 408 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WZ62 844 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CYB561D2O14569 222 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TM9SF1O15321 606 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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