RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TMEM143Q96AN5 459 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 MSH4O15457 936 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 B3GAT3O94766 335 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 YY1P25490 414 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 POTEGQ6S5H5 508 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 RTN2O75298 545 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ALDH2P05091 517 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 AIM2O14862 343 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ENDOD1O94919 500 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CYP2A7P20853 494 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 IL13P35225 146 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 OXCT1P55809 520 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 VTA1Q9NP79 307 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SAMD9Q5K651 1589 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 A0A087WZ62 844 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 PMPCBO75439 489 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 MCEEQ96PE7 176 aa14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 IL6P05231 212 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SCARF1Q14162 830 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ATL2Q8NHH9 583 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 LPAR1Q92633 364 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 GRAP2O75791 330 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CRTAMO95727 393 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 NLRP14Q86W24 1093 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 FAM129BQ96TA1 746 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 POTEMA6NI47 508 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TRIM24O15164 1050 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 OR6B1O95007 311 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CCNIQ14094 377 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 EMBQ6PCB8 327 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 VAV3Q9UKW4 847 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 E2F8A0AVK6 867 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 POTECB2RU33 542 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 FOXP2O15409 715 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 USP41Q3LFD5 358 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 FAM171BQ6P995 826 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 FAM196BA6NMK8 535 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CHL1O00533 1208 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SCP2P22307 547 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 PPP2R2AP63151 447 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 A0A1W2PQ27 194 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 A0A1W2PQ64 194 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 A0A1W2PQD8 194 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 F5H6K3 240 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 SNX4O95219 450 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 HSMCR30P0CW71 290 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ITGALP20701 1170 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ACOT2P49753 483 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 KLRC3Q07444 240 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CGRRF1Q99675 332 aa14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 RHOCP08134 193 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 GRIK3Q13003 919 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 DPY30Q9C005 99 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.8□□□□□ -0.04
SPRED1-201ENST00000299084 CEP170Q5SW79 1584 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms