RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TNNC2P02585 160 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 NUDT2P50583 147 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GPX6P59796 221 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CDC16Q13042 620 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MIS12Q9H081 205 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ADA2Q9NZK5 511 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 SLC7A8Q9UHI5 535 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 PEX2P28328 305 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 OCRLQ01968 901 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 DGKZQ13574 1117 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 NLRP4Q96MN2 994 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CEP41Q9BYV8 373 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 KLHL33A6NCF5 533 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MTA2O94776 668 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 OR6B1O95007 311 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ABCG1P45844 678 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MYL6P60660 151 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 GTF2BQ00403 316 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MYBPC2Q14324 1141 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ZNF677Q86XU0 584 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 MBOAT7Q96N66 472 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 AGAP3Q96P47 875 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.9■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CAPN8A6NHC0 703 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 ALDH1B1P30837 517 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TMEM165Q9HC07 324 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TMEM63AO94886 807 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 JAK3P52333 1124 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 BTAF1O14981 1849 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GUL6 1792 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 A0A0B4J269 797 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 PDGFRAP16234 1089 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 AQP4P55087 323 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 USP46P62068 366 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 KRT76Q01546 638 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 PRKCEQ02156 737 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 LCA5Q86VQ0 697 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TREML1Q86YW5 311 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 MCUQ8NE86 351 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 BSNDQ8WZ55 320 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.89■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TBC1D12O60347 775 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TCEA3O75764 348 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 KLRC2P26717 231 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 CES3Q6UWW8 571 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 HPS6Q86YV9 775 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 SP8Q8IXZ3 490 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 MYPNQ86TC9 1320 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 EXTL3O43909 919 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TYROBPO43914 113 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 UGT1A9O60656 530 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 PMLP29590 882 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 CDH8P55286 799 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TAF5Q15542 800 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 EFHC2Q5JST6 749 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TMC2Q8TDI7 906 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.88■□□□□ 0.13
USP25-201ENST00000285679 CISHQ9NSE2 258 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms