RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 USP33Q8TEY7 942 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SDCBP2Q9H190 292 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 IL37Q9NZH6 218 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 E2F8A0AVK6 867 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TNFRSF10BO14763 440 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 AP1G2O75843 785 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SYKP43405 635 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf27AQ580R0 203 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SV2AQ7L0J3 742 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 UNC93AQ86WB7 457 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-201ENST00000250495 SPTBN2O15020 2390 aa22.33■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 EML5Q05BV3 1969 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MAPK13O15264 365 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GDF9O60383 454 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 RHOBTB1O94844 696 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ADH1CP00326 375 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 DGKEP52429 567 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SLC5A3P53794 718 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ELF2Q15723 593 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GAB4Q2WGN9 574 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 PLK5Q496M5 336 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 FUKQ8N0W3 1084 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 OTUB2Q96DC9 234 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 PNKPQ96T60 521 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 FAM92AA1XBS5 289 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 COCHO43405 550 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 TUBP50607 506 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 NDST1P52848 882 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SEC13P55735 322 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 C11orf74Q86VG3 221 aa22.31■■□□□ 1.16
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NEDD8-201ENST00000250495 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 KRT82Q9NSB4 513 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MYH10P35580 1976 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0A0MRY4 1105 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 RHOBTB3O94955 611 aa22.3■■□□□ 1.16
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NEDD8-201ENST00000250495 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SLC6A11P48066 632 aa22.3■■□□□ 1.16
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NEDD8-201ENST00000250495 LIMK1P53667 647 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 NFIL3Q16649 462 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 IL31Q6EBC2 164 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SMOQ99835 787 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 NACA2Q9H009 215 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 KAT7O95251 611 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 HLA-DRAP01903 254 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ADH5P11766 374 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC130P13994 396 aa22.29■■□□□ 1.16
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NEDD8-201ENST00000250495 PIK3CAP42336 1068 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFA8P51970 172 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GAD2Q05329 585 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC6Q16204 474 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 VPS45Q9NRW7 570 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GMIPQ9P107 970 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 DCLK1O15075 740 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 BEST1O76090 585 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 KRT13P13646 458 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 MPLP40238 635 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GRIA2P42262 883 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 TNFRSF4P43489 277 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ASPAP45381 313 aa22.28■■□□□ 1.16
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