RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM49D1C9J1S8 452 aa28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ATG7O95352 703 aa28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CYB561D2O14569 222 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 FAM189A1O60320 539 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZCCHC18P0CG32 403 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 RAP1GAPP47736 663 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 SLC18A2Q05940 514 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 FSTL1Q12841 308 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TAZQ16635 292 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 DUOXA2Q1HG44 320 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A41Q8N5S1 370 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 PPM1NQ8N819 430 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 WDR35Q9P2L0 1181 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 POLIQ9UNA4 740 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 COPEO14579 308 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MCF2LO15068 1137 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ADCY3O60266 1144 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MMRN1Q13201 1228 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 REPS2Q8NFH8 660 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 SLC13A1Q9BZW2 595 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 EGFRP00533 1210 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ASPAP45381 313 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 RAB27AP51159 221 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 BST1Q10588 318 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF699Q32M78 642 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 GALNT15Q8N3T1 639 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 SHKBP1Q8TBC3 707 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CPXM1Q96SM3 734 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 APOC2P02655 101 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MIPP30301 263 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 AP3M2P53677 418 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 GATA6Q92908 595 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF212Q9UDV6 495 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 USP1O94782 785 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TMPRSS15P98073 1019 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 BMPR2Q13873 1038 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC110Q8TBZ0 833 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ACAP3Q96P50 834 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TTC1Q99614 292 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 THTPAQ9BU02 230 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TEX264Q9Y6I9 313 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 FAXCQ5TGI0 409 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 KCNN1Q92952 543 aa28.17■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 OSTNP61366 133 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 PANX3Q96QZ0 392 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 UGT1A9O60656 530 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ERBB2P04626 1255 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CDH8P55286 799 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CXCL9Q07325 125 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 IZUMO2Q6UXV1 221 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM130Q8N3G9 435 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CFAP61Q8NHU2 1237 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 LRRN4Q8WUT4 740 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 UGT1A7Q9HAW7 530 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 UGT1A10Q9HAW8 530 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 UGT1A8Q9HAW9 530 aa28.16■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 BAG2O95816 211 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TSHRP16473 764 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 FGD4Q96M96 766 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 XYLT2Q9H1B5 865 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MAGEA13PA6NCF6 341 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 CAPN14A8MX76 684 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 TOM1L1O75674 476 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MAP3K6O95382 1288 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 BACE1P56817 501 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 XYLT1Q86Y38 959 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 MFN1Q8IWA4 741 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 SCUBE1Q8IWY4 988 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 USP18Q9UMW8 372 aa28.15■■■□□ 2.1
FAM149A-201ENST00000227065 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms