RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216456.6

VTI1B-201, Transcript of vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VTI1B, Length 1,103 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1B-201ENST00000216456 K7EQS6 105 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 NFATC1O95644 943 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 MYL1P05976 194 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 ADORA2BP29275 332 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 MAP3K7CLP57077 242 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 AMPD2Q01433 879 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 SEMA4GQ9NTN9 838 aa23.47■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 DCDC2BA2VCK2 349 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 DCLK1O15075 740 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 AXIN1O15169 862 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 GDF9O60383 454 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 PDE6CP51160 858 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 PNOCQ13519 176 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 DHCR24Q15392 516 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 C2orf27AQ580R0 203 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 TNIP3Q96KP6 325 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 IL37Q9NZH6 218 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 EHD2Q9NZN4 543 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 INVSQ9Y283 1065 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.46■■□□□ 1.35
VTI1B-201ENST00000216456 IKBKBO14920 756 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ATG13O75143 517 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 RPP40O75818 363 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 PFKLP17858 780 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CD58P19256 250 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CNR2P34972 360 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 PPP3CCP48454 512 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 FOXK2Q01167 660 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 NR1H3Q13133 447 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 DMC1Q14565 340 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 WHAMMQ8TF30 809 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 GAB3Q8WWW8 586 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.45■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ATP8B3O60423 1300 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 EML5Q05BV3 1969 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 TBX18O95935 607 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 IRF1P10914 325 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 LMNB2Q03252 620 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ADAM9Q13443 819 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 EMC10Q5UCC4 262 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SEMA4DQ92854 862 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 OSER1Q9NX31 292 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.44■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 NCOR2Q9Y618 2525 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CCDC192P0DO97 292 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 P4HA1P13674 534 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 KDSRQ06136 332 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 FBXO43Q4G163 708 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 HECTD3Q5T447 861 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SYT13Q7L8C5 426 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 USP33Q8TEY7 942 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 TAF4BQ92750 862 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 RXFP3Q9NSD7 469 aa23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 FAM92AA1XBS5 289 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 HHLA1C9JL84 531 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 MAPK13O15264 365 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CYP26A1O43174 497 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 NFIL3Q16649 462 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 PRR23CQ6ZRP0 262 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 NAT16Q8N8M0 369 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SPTBN2O15020 2390 aa23.42■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 MDM4O15151 490 aa23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 TRIM24O15164 1050 aa23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 KRT13P13646 458 aa23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 INCA1Q0VD86 236 aa23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 ZNF394Q53GI3 561 aa23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.41■■□□□ 1.34
VTI1B-201ENST00000216456 UNC93AQ86WB7 457 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms