RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W GSP1P32835 219 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data5.3□□□□□ -1.56not detected
YLR349WYLR349W YER039C-AP0CD97 72 aa5.29□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W AIM11P87275 137 aa5.29□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa5.29□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W DDR2P89113 61 aa5.28□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W YLL006W-AQ3E814 58 aa5.28□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W YGL118CP53132 145 aa5.26□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YGR121W-AQ3E816 71 aa5.26□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W MBF1O14467 151 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W GSP2P32836 220 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YML079WQ03629 201 aa5.25□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YMR103CQ04436 120 aa5.25□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa5.24□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YDL022C-AP0C5L6 82 aa5.23□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YPL257WQ08974 193 aa5.23□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa5.23□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W COX10P21592 462 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W PEX17P40155 199 aa5.22□□□□□ -1.57
YLR349WYLR349W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa5.21□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W POP3P53833 195 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W HTL1Q9URQ5 78 aa5.2□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W RPL28P02406 149 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W QCR8P08525 94 aa5.19□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W CYT2Q00873 224 aa5.19□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W MRPS12P53732 153 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YOR020W-AQ3E824 90 aa5.18□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W HAP3P13434 144 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YER134CP40081 178 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YPL073CP40323 161 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YAL063C-AQ3E791 96 aa5.17□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W UBC11P52492 156 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W BSC4P53841 131 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YNL190WP53872 204 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W HPA2Q06592 156 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YPL261CQ08976 102 aa5.16□□□□□ -1.58
YLR349WYLR349W YCR007CP25354 239 aa5.15□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YBR027CP38220 110 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W NSE4P43124 402 aa5.14□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YKR041WP36134 250 aa5.13□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YBR230W-AQ3E762 66 aa5.13□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YHR007C-AQ07074 71 aa5.11□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YJL127C-BQ3E828 52 aa5.11□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
YLR349WYLR349W YEL067CP39978 195 aa5.08□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W ATP5P09457 212 aa5.06□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W UGX2P32772 223 aa5.06□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W YHL005CP38752 130 aa5.04□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W HHO1P53551 258 aa5.04□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W YOR072WQ08486 104 aa5.04□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W MID2P36027 376 aa5.03□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W IRC21Q04772 201 aa5.03□□□□□ -1.6
YLR349WYLR349W FYV5P25585 152 aa5.02□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W PAU17Q12370 124 aa5.02□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W ICY1Q04329 127 aa5□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W SCS22Q6Q595 175 aa5□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W YNR077CP53758 84 aa4.99□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W ZEO1Q08245 113 aa4.99□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W YLR236CA0A023PZG4 107 aa4.98□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W YIA6P40556 373 aa4.97□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W IGO2Q9P305 131 aa4.97□□□□□ -1.61
YLR349WYLR349W GTT1P40582 234 aa4.95□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YFR057WP43625 151 aa4.95□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YNL184CP53876 108 aa4.95□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W RGM1Q00453 211 aa4.95□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YOR034C-AQ3E735 80 aa4.95□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YHR139C-AO13536 103 aa4.94□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W ARL3Q02804 198 aa4.94□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W BET1P22804 142 aa4.93□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YEL045CP32616 141 aa4.93□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W YCR043CP25361 127 aa4.92□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W COX7P10174 60 aa4.91□□□□□ -1.62
YLR349WYLR349W MRPL44P19956 98 aa4.89□□□□□ -1.63
YLR349WYLR349W MSA2P36157 363 aa4.89□□□□□ -1.63
YLR349WYLR349W YKL044WP36092 106 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR349WYLR349W YDL157CQ12082 118 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR349WYLR349W SEC11P15367 167 aa4.84□□□□□ -1.63
YLR349WYLR349W MPC3P53311 146 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W CNL1Q06333 122 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W PAU23Q07987 124 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W RSM18P40033 138 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W CWC27Q02770 301 aa4.8□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W YLR157W-DP0CE99 70 aa4.78□□□□□ -1.64
YLR349WYLR349W YHR130CP38834 111 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms