RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	COX19	Q3E731	98 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	BRP1	P53194	125 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	SNA2	P56508	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YML122C	Q03207	126 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	DAD4	P69851	72 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YHR173C	P38864	112 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YIR020C	P40575	100 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	PPT2	Q12036	173 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	YHR180W	P38868	163 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	REE1	P40893	198 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NUP133	YKR082W	PAU6	P0CE90	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU18	P0CE91	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU8	P0CE92	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU11	P0CE93	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU13	P38725	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU4	P53427	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU10	Q03050	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YOR314W	Q12506	109 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU9	Q3E770	120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	SED1	Q01589	338 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	RTC6	O14464	93 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YHR022C	P38763	256 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	VPS68	Q12016	184 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	HOT13	P36078	116 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YEL067C	P39978	195 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YMR122C	Q03879	124 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YDR115W	Q04598	105 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YPR153W	Q06537	140 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YPR013C	Q12145	317 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	QCR9	P22289	66 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	MPC2	P38857	129 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YAL065C	O13511	128 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	IGD1	P43598	195 aa		3	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YBL071C	P38185	102 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	QCR8	P08525	94 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YNR077C	P53758	84 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	IRC21	Q04772	201 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	PAU20	Q08322	120 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	TAO3	P40468	2376 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	COX9	P07255	59 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	HSP150	P32478	413 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	FAB1	P34756	2278 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YDR010C	Q12426	110 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NUP133	YKR082W	YFL067W	P43537	175 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	AGA2	P32781	87 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	MIG3	P39943	394 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	PAU7	P39545	55 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	POR2	P40478	281 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	FLO5	P38894	1075 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YKR073C	P36153	106 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	NCE101	Q02820	53 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	SPI1	P40092	148 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	CSF1	Q12150	2958 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YEL014C	P39999	101 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	MRX7	P53869	86 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	COX8	P04039	78 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	RPS27B	P38711	82 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	FLO9	P39712	1322 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	IRA2	P19158	3079 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	BSC4	P53841	131 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	MIX17	Q03667	156 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	PRM7	Q12459	698 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	IRA1	P18963	3092 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.94
NUP133	YKR082W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		2.9	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms