RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 SIX2Q9NPC8 291 aa16.42■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 KRT82Q9NSB4 513 aa16.42■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 TDP1Q9NUW8 608 aa16.42■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 CCL26Q9Y258 94 aa16.42■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.42■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 FAM200BP0CF97 657 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 VDRP11473 427 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 PON1P27169 355 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 YWHAQP27348 245 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 AVPR2P30518 371 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 KIF11P52732 1056 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 MAP3K7CLP57077 242 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 SLC7A9P82251 487 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 PFKPQ01813 784 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 FZD5Q13467 585 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 TTC30AQ86WT1 665 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 TFAP2BQ92481 460 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 MED10Q9BTT4 135 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 NDST4Q9H3R1 872 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 ANO10Q9NW15 660 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.41■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 O00370 1275 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 PI15O43692 258 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 GABBR2O75899 941 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 ADORA2BP29275 332 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 PRKCQQ04759 706 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 GRM2Q14416 872 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 CNGA2Q16280 664 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 VWA3BQ502W6 1294 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 RRAGAQ7L523 313 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 SIX5Q8N196 739 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 IRF7Q92985 503 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 GCNAQ96QF7 691 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 SCML2Q9UQR0 700 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 MYH10P35580 1976 aa16.4■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 F5P12259 2224 aa16.39■□□□□ 0.22
BECN1-211ENST00000589636 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 BECN2A8MW95 431 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 USP17L7P0C7H9 530 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 GLULP15104 373 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ZNF18P17022 549 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 HDCP19113 662 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 AOC1P19801 751 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 GDI1P31150 447 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 TUBP50607 506 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 NUBP1P53384 320 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ZNF77Q15935 545 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 GBP6Q6ZN66 633 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 PDZD8Q8NEN9 1154 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 OSBPL6Q9BZF3 934 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 COL4A3Q01955 1670 aa16.39■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 KCNJ18B7U540 433 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 AVPR1AP37288 418 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 APBA1Q02410 837 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 USP4Q13107 963 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 KCNJ12Q14500 433 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 STX1AQ16623 288 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 SGO2Q562F6 1265 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 TMEM270Q6UE05 265 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.38■□□□□ 0.21
BECN1-211ENST00000589636 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms