RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 SHHQ15465 462 aa24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 VSTM1Q6UX27 236 aa24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 HES6Q96HZ4 224 aa24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX12Q9UMY4 172 aa24.59■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC1A1P43005 524 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 TKTL1P51854 596 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 OGDHQ02218 1023 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPS6KA1Q15418 735 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.58■■□□□ 1.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTMR11A4FU01 709 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADAM12O43184 909 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 URODP06132 367 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 BMPR1AP36894 532 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGEA11P43364 429 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDUFV1P49821 464 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADCY1Q08828 1119 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAF5Q15542 800 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR65Q8IYL9 337 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 EMC1Q8N766 993 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNGB3Q9NQW8 809 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAN1A1P33908 653 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR1D2P34982 312 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ROR1Q01973 937 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 L2HGDHQ9H9P8 463 aa24.57■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR27A2RRH5 827 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 LINC01553A4QN01 128 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPOPO43791 374 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRAP2O75791 330 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXO21O94952 628 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TUBB2AQ13885 445 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARCQ7LC44 396 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD101Q93033 1021 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 C8orf48Q96LL4 319 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.56■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM66O15016 1216 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 VNN2O95498 520 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDC23Q9UJX2 597 aa24.55■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SRGAP2O75044 1071 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMA2P25787 234 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 FLT3P36888 993 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNA2P51530 1060 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMB7Q99436 277 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLVAPQ9BX97 442 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBP1Q9H171 429 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP3Q9Y6I4 520 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFRSF10BO14763 440 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 LILRB3O75022 631 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTSAP10619 480 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYOGP15173 224 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDGFRAP16234 1089 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJB2P25686 324 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTNNB1P35222 781 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 PM20D1Q6GTS8 502 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRNP1Q6NT89 227 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF461Q8TAF7 563 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.54■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSF2BPO75031 334 aa24.53■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBED1O96006 694 aa24.53■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 GLI1P08151 1106 aa24.53■■□□□ 1.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L7P0C7H9 530 aa24.53■■□□□ 1.52
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