RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0C4DFX4 3053 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CACNA1SQ13698 1873 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 APOL1O14791 398 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GRM6O15303 877 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SLC26A4O43511 780 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TBC1D4O60343 1298 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 B4GALT4O60513 344 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SGPL1O95470 568 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TSHRP16473 764 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TYRP1P17643 537 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ATP5JP18859 108 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH1A3P47895 512 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FLT3LGP49771 235 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NPEPPSP55786 919 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 APBA1Q02410 837 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CCL15Q16663 113 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 AFMIDQ63HM1 303 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 OPTNQ96CV9 577 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 EPC1Q9H2F5 836 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SRRDQ9UH36 339 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PIP5K1CO60331 668 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FGF18O76093 207 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CHKAP35790 457 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PSMC4P43686 418 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 KCNC1P48547 511 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GZMKP49863 264 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NOMO3P69849 1222 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BIRC3Q13489 604 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PMS2P11Q13670 270 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 STARD3Q14849 445 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ELF2Q15723 593 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF124Q15973 351 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 EMC10Q5UCC4 262 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC174Q6PII3 467 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FAM124AQ86V42 546 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ERO1BQ86YB8 467 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA5Q8NB90 893 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ARL8AQ96BM9 186 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CEP95Q96GE4 821 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH6Q9H252 994 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 BRD9Q9H8M2 597 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SERHLQ9NQF3 203 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 LUZP4Q9P127 313 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 F8W8V4 182 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS3O15072 1205 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FGAP02671 866 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GNAI2P04899 355 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CCL5P13501 91 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 HDCP19113 662 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ICA1Q05084 483 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PPATQ06203 517 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SLC13A2Q13183 592 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PKN1Q16512 942 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PRR16Q569H4 304 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.31□□□□□ -1.4
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