RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 GAD2Q05329 585 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 MTM1Q13496 603 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 20.3
GGA3-205ENST00000578348 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 DGKDQ16760 1214 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ZNF410Q86VK4 478 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 BCO2Q9BYV7 579 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 SIX4Q9UIU6 781 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ALOX15BO15296 676 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 TYROBPO43914 113 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 WEE2P0C1S8 567 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 FGFR1P11362 822 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ATICP31939 592 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 TAP1Q03518 808 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 IRF5Q13568 498 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 NLRP7Q8WX94 980 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 PTPN18Q99952 460 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 POLIQ9UNA4 740 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GGA3-205ENST00000578348 WDR91A4D1P6 747 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 MED7O43513 233 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 TSPAN1O60635 241 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ATP5HO75947 161 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CBX6O95503 412 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 KRT19P08727 400 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SSTR1P30872 391 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CDKN2BP42772 138 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SLC18A1P54219 525 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 GPX6P59796 221 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 HIF1AQ16665 826 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 JADE1Q6IE81 842 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 C10orf82Q8WW14 230 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CPB2Q96IY4 423 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ITGAVP06756 1048 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 PAX7P23759 505 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 GDF10P55107 478 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CCDC142Q17RM4 750 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 PARP6Q2NL67 630 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 LRRC38Q5VT99 294 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 TFAP2BQ92481 460 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 NPHS2Q9NP85 383 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.95□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 GOLGA8RI6L899 631 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 WFS1O76024 890 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ITGB3P05106 788 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 T-ENOLP0DO92 83 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 P4HA1P13674 534 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ADRA1DP25100 572 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-205ENST00000578348 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms