RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561292.1

PRTG-204, Transcript of protogenin, human

TSL 3 BASIC

Gene PRTG, Length 833 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRTG-204	ENST00000561292	CPA6	Q8N4T0	437 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PRTG-204	ENST00000561292	DCLK2	Q8N568	766 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PRTG-204	ENST00000561292	ATP2A3	Q93084	1043 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PRTG-204	ENST00000561292	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PRTG-204	ENST00000561292	RNF38	Q9H0F5	515 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PRTG-204	ENST00000561292	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PRTG-204	ENST00000561292		K7ESF4	209 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	OLFM2	O95897	454 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	KRT13	P13646	458 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	YWHAQ	P27348	245 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	GCLM	P48507	274 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	NDST1	P52848	882 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SLC7A9	P82251	487 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ORC1	Q13415	861 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	UNC93A	Q86WB7	457 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FUK	Q8N0W3	1084 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ZNF292	O60281	2723 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	LEFTY2	O00292	366 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ABL1	P00519	1130 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	GALK1	P51570	392 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	DMWD	Q09019	674 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FRYL	O94915	3013 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	TNFRSF10B	O14763	440 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	AP1G2	O75843	785 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	EGF	P01133	1207 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CCDC130	P13994	396 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FBXO32	Q969P5	355 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	KRT82	Q9NSB4	513 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	RMND1	Q9NWS8	449 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	IL37	Q9NZH6	218 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CPQ	Q9Y646	472 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FNTB	P49356	437 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SLC5A3	P53794	718 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	INCA1	Q0VD86	236 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	C12orf29	Q8N999	325 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SMO	Q99835	787 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	NCDN	Q9UBB6	729 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	BEST1	O76090	585 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	DRD1	P21728	446 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	PRCP	P42785	496 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	NR1H3	Q13133	447 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CD101	Q93033	1021 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	EXOC4	Q96A65	974 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	GSDMA	Q96QA5	445 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	TWNK	Q96RR1	684 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	24.91	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	FAM92A	A1XBS5	289 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	RNF40	O75150	1001 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	NFATC1	O95644	943 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	HOXA6	P31267	233 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	HOXC13	P31276	330 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	GTF2H1	P32780	548 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	KRT39	Q6A163	491 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	LONP2	Q86WA8	852 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	COMMD8	Q9NX08	183 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	CETN3	O15182	167 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PRTG-204	ENST00000561292	ID4	P47928	161 aa		24.89	■■□□□ 1.58

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