RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558006.1

AC009996.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC009996.1, Length 653 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009996.1-201ENST00000558006 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 HVCN1Q96D96 273 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 LOXL4Q96JB6 756 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 HHIPQ96QV1 700 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
AC009996.1-201ENST00000558006 CACNA1GO43497 2377 aa10.15□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 MYOFQ9NZM1 2061 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 GON4LQ3T8J9 2241 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ANTXRLA6NF34 631 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 GIPC1O14908 333 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ITGB3P05106 788 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 C1QTNF9P0C862 333 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ADSSP30520 456 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 MPLP40238 635 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 GALK1P51570 392 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 MYL7Q01449 175 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 MTF1Q14872 753 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 PDGFRLQ15198 375 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 DDR2Q16832 855 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 PLK5Q496M5 336 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 MON1AQ86VX9 555 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CPA6Q8N4T0 437 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 EXOC4Q96A65 974 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SAAL1Q96ER3 474 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 EPSTI1Q96J88 318 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 L1RE1Q9UN81 338 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 AGAP1Q9UPQ3 857 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 EXOC7Q9UPT5 735 aa10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SOBPA7XYQ1 873 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 HUS1O60921 280 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TADA3O75528 432 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 AKAP3O75969 853 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 NOL4O94818 638 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 GCNT3O95395 438 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CKMP06732 381 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 KRT19P08727 400 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SPINK2P20155 84 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 PDCP20941 246 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 DRD1P21728 446 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CYP2F1P24903 491 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 GJA4P35212 333 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 IFNAR2P48551 515 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 FAM160A1Q05DH4 1040 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 FBXO43Q4G163 708 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 RNF43Q68DV7 783 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CYP2U1Q7Z449 544 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 FAM84AQ96KN4 292 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ACCSQ96QU6 501 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 P2RY13Q9BPV8 354 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ACBD6Q9BR61 282 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ABCB6Q9NP58 842 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 STK17AQ9UEE5 414 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 INVSQ9Y283 1065 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SNX9Q9Y5X1 595 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 PI4KAP42356 2102 aa10.13□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 SPEGQ15772 3267 aa10.12□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.12□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
AC009996.1-201ENST00000558006 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms