RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA18Q8TC71 538 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC39Q96DD0 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ATG4CQ96DT6 458 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ABCG4Q9H172 646 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PHF24Q9UPV7 400 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PASKQ96RG2 1323 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 C21orf59P57076 290 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RBP5P82980 135 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K10Q02779 954 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CUL4AQ13619 759 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF425Q6IV72 752 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRGUKQ96M69 825 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 UROC1Q96N76 676 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TTC25Q96NG3 672 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPC1 479 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP69A5D8W1 941 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ADM5C9JUS6 153 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MTSS1O43312 755 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GUCA1CO95843 209 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PRKCBP05771 671 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 THPOP40225 353 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA9Q13797 1035 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 INAVAQ3KP66 663 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR8Q96EF0 704 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF21O75509 655 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYND10O75800 440 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 UBE3AQ05086 875 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LONRF1Q17RB8 773 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CBX8Q9HC52 389 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RNF186Q9NXI6 227 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NR2E1Q9Y466 385 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CNTNAP1P78357 1384 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF202O95125 648 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ODC1P11926 461 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PROM2Q8N271 834 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TEX12Q9BXU0 123 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF609O15014 1411 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 I3L4J1 428 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN4O14817 238 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP21A2P08686 494 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EPHB1P54762 984 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MORF4L2Q15014 288 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GIPC3Q8TF64 312 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IER2Q9BTL4 223 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 VPS11Q9H270 941 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R37O75864 691 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 OR5F1O95221 314 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2D6P10635 497 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CPA1P15085 419 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 F8A1P23610 371 aa6.54□□□□□ -1.36
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