RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KALRNO60229 2985 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MAP3K13O43283 966 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KLRC4O43908 158 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MOSPD3O75425 235 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CMA1P23946 247 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RNF214Q8ND24 703 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 BORCS6Q96GS4 357 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TNMDQ9H2S6 317 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RP1P56715 2156 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CENPEQ02224 2701 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 WDR81Q562E7 1941 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PPP6R2O75170 966 aa7.99□□□□□ -1.13
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CS-212ENST00000548567 SRFP11831 508 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 IFNAR2P48551 515 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MXI1P50539 228 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 POU5F1BQ06416 359 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TAF5Q15542 800 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZBTB6Q15916 424 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TMEM25Q86YD3 366 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PAF1Q8N7H5 531 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 NELFBQ8WX92 580 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZNF560Q96MR9 790 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.99□□□□□ -1.13
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CS-212ENST00000548567 CETN3O15182 167 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 VNN1O95497 513 aa7.98□□□□□ -1.13
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CS-212ENST00000548567 SYCP1Q15431 976 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 HYIQ5T013 277 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DENND1CQ8IV53 801 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ALLCQ8N6M5 410 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RNF34Q969K3 372 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ASB7Q9H672 318 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DPP7Q9UHL4 492 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 H0YCG3 227 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ABLIM3O94929 683 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SLC5A3P53794 718 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 GPT2Q8TD30 523 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SYN3O14994 580 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TLR5O60602 858 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CFIP05156 583 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 SLC9A1P19634 815 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 BMP6P22004 513 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 KLK7P49862 253 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 FAM193AP78312 1265 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-212ENST00000548567 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.97□□□□□ -1.13
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