RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546909.2

CR383656.4-201, humanhuman

BASIC

Gene CR383656.4, Length 122 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR383656.4-201ENST00000546909 PMS2P54278 862 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 GYS2P54840 703 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 PER3P56645 1201 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 LILRA4P59901 499 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RPS13P62277 151 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 B4GALNT1Q00973 533 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DEUP1Q05D60 604 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 LMAN2Q12907 356 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 GPS2Q13227 327 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 KCNC3Q14003 757 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 LRRC32Q14392 662 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RASA3Q14644 834 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SHBQ15464 509 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TERF2Q15554 542 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ADRM1Q16186 407 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SMTNL2Q2TAL5 461 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 MTERF2Q49AM1 385 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ANO6Q4KMQ2 910 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 CCDC178Q5BJE1 867 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DEPDC1Q5TB30 811 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 BROXQ5VW32 411 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TTLL5Q6EMB2 1281 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RETSATQ6NUM9 610 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SWSAP1Q6NVH7 229 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMEM108Q6UXF1 575 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RANBP10Q6VN20 620 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 Q6ZVH6 145 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ZNF365Q70YC5 407 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DPH6Q7L8W6 267 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ZNF804AQ7Z570 1209 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DTX2Q86UW9 622 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 GPSM1Q86YR5 675 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SFTPA1Q8IWL2 248 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ZNF610Q8N9Z0 462 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SMC1BQ8NDV3 1235 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TAS1R2Q8TE23 839 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMEM171Q8WVE6 324 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMED6Q8WW62 240 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ATRIPQ8WXE1 791 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 PHF21BQ96EK2 531 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 KAZALD1Q96I82 304 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMX3Q96JJ7 454 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SPATA32Q96LK8 384 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 CCDC17Q96LX7 622 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SLC2A13Q96QE2 648 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SNX18Q96RF0 628 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 OSBPL9Q96SU4 736 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TUBB6Q9BUF5 446 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 C1orf43Q9BWL3 253 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TTYH3Q9C0H2 523 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 BCL11AQ9H165 835 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 IL25Q9H293 177 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 AAMDCQ9H7C9 122 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 KANSL2Q9H9L4 492 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 IFT122Q9HBG6 1241 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 GLOD4Q9HC38 313 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 VTA1Q9NP79 307 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMEM140Q9NV12 185 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMEM45AQ9NWC5 275 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 TMEM248Q9NWD8 314 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 OCIAD1Q9NX40 245 aa0.09□□□□□ -2.4
CR383656.4-201ENST00000546909 MOCS1Q9NZB8 636 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms