RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544823.5

QKI-215, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 2

Gene QKI, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-215	ENST00000544823	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	AP1G1	O43747	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TJP3	O95049	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	PRF1	P14222	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	KCNA3	P22001	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CCKBR	P32239	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	LINC00205	P59089	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	FGL2	Q14314	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	OFD1	O75665	1012 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	FGA	P02671	866 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TH	P07101	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CBSL	P0DN79	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	KIT	P10721	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CYP2C9	P11712	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	AKAP5	P24588	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CBS	P35520	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	RAB1A	P62820	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CTBP1	Q13363	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.55	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	BTN3A1	O00481	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	RNF8	O76064	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	A1BG	P04217	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MYB	P10242	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823		A0A1W2PPL8	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823		H3BNX3	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	RGS10	O43665	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	PMPCB	O75439	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	RASAL1	O95294	804 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	GK	P32189	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ITGA8	P53708	1063 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	LMAN2	Q12907	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
QKI-215	ENST00000544823		A0A087WWL8	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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