RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	EPHA4	P54764	986 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	BFSP1	Q12934	665 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PSMD2	Q13200	908 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PKP1	Q13835	747 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PSMD6	Q15008	389 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TMC8	Q8IU68	726 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CXorf38	Q8TB03	319 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	HPDL	Q96IR7	371 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM209	Q96SK2	561 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TASP1	Q9H6P5	420 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SIX4	Q9UIU6	781 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1W2PQ27	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1W2PQ64	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474		A0A1W2PQD8	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF263	O14978	683 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CHAD	O15335	359 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	EXOC3	O60645	756 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FURIN	P09958	794 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CSH1	P0DML2	217 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CSH2	P0DML3	217 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PFKFB1	P16118	471 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ATF6	P18850	670 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TNNI1	P19237	187 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	GABRR2	P28476	465 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	GDI1	P31150	447 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	HOXD13	P35453	343 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	VIPR2	P41587	438 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	MAGEA11	P43364	429 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	AFM	P43652	599 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CYP24A1	Q07973	514 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TRPC3	Q13507	836 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CUL4B	Q13620	913 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	GRM2	Q14416	872 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PPP2R5D	Q14738	602 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	GPR158	Q5T848	1215 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	VIT	Q6UXI7	678 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	GAREM2	Q75VX8	874 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	HPS3	Q969F9	1004 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CLDN23	Q96B33	292 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PAGE5	Q96GU1	130 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	SPATA32	Q96LK8	384 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	CGRRF1	Q99675	332 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	FOXQ1	Q9C009	403 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RCN1-208	ENST00000532474	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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