RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIOO75962 3097 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM92AA1XBS5 289 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM221A6NGB7 291 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 M0R296 226 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PRAMEF12O95522 483 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TPM2P07951 284 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF18P17022 549 aa20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS16Q9H269 839 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-208ENST00000531226 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-208ENST00000531226 CFHP08603 1231 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PFKLP17858 780 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMC3P17980 439 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 BCAT1P54687 386 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 GPC5P78333 572 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNMA1Q12791 1236 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 GRM2Q14416 872 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC30AQ86WT1 665 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TFAP2BQ92481 460 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-208ENST00000531226 WNT16Q9UBV4 365 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 HESX1Q9UBX0 185 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 C2orf78A6NCI8 922 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR33A8MZF0 331 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 DPYSL4O14531 572 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT5P13647 590 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF165P49910 485 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE6CP51160 858 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC8A3P57103 927 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
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PACSIN3-208ENST00000531226 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SMTNL1A8MU46 457 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CKMP06732 381 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L7P0C7H9 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF11P52732 1056 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PFKPQ01813 784 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 STILQ15468 1287 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PIGZQ86VD9 579 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SHC3Q92529 594 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC22A12Q96S37 553 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TDP1Q9NUW8 608 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 GMIPQ9P107 970 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL26Q9Y258 94 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 BECN2A8MW95 431 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 OLFM2O95897 454 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ABL1P00519 1130 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SETSIPP0DME0 302 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 HDCP19113 662 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 GDI1P31150 447 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE4CQ08493 712 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CNGA2Q16280 664 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PKDCCQ504Y2 493 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.06■□□□□ 0.8
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