RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 LUZP4Q9P127 313 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TJP1Q07157 1748 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MEI4A8MW99 385 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CES2O00748 559 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DAPK3O43293 454 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CHMP2AO43633 222 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL41O60662 606 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NFATC1O95644 943 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 F2P00734 622 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TNNC2P02585 160 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GLI1P08151 1106 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GSTA1P08263 222 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KLRC1P26715 233 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SCNN1AP37088 669 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PMS2P54278 862 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 COASYQ13057 564 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HYIQ5T013 277 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CENPPQ6IPU0 288 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC39CQ8N584 583 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DNASE1L2Q92874 299 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SAAL1Q96ER3 474 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MTRQ99707 1265 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TLR10Q9BXR5 811 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANO3Q9BYT9 981 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GDF3Q9NR23 364 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GCNT4Q9P109 453 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AMACRQ9UHK6 382 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH8P13535 1937 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NMT2O60551 498 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SNX2O60749 519 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LILRB3O75022 631 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AGTP01019 485 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ALPPL2P10696 532 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SFTPCP11686 197 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 INSRRP14616 1297 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 IL9RQ01113 521 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRPC3Q13507 836 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EOGTQ5NDL2 527 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SERINC5Q86VE9 423 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LOXL4Q96JB6 756 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SNX27Q96L92 541 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CLUHO75153 1309 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF233A6NK53 670 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AGPSO00116 658 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NDC80O14777 642 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR37O15354 613 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 THAP12O43422 761 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KRT38O76015 456 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF286BP0CG31 522 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HALP42357 657 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SCTRP47872 440 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 INHBCP55103 352 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MXRA7P84157 204 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PDGFRLQ15198 375 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR16Q569H4 304 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms