RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490510.5

PITRM1-211, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-211ENST00000490510 OLFM2O95897 454 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ABL1P00519 1130 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 DRD1P21728 446 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 PPP3CCP48454 512 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 PDE6CP51160 858 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SLC7A9P82251 487 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FAM35AQ86V20 835 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 KCNK16Q96T55 309 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.37■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FOXK2Q01167 660 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ORC1Q13415 861 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NUP93Q8N1F7 819 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CD101Q93033 1021 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CPQQ9Y646 472 aa20.36■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 IKBKBO14920 756 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 AKAP3O75969 853 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 YWHAQP27348 245 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CNR2P34972 360 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ACOT1Q86TX2 421 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FUKQ8N0W3 1084 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 TNIP3Q96KP6 325 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 MED10Q9BTT4 135 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
PITRM1-211ENST00000490510 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 USP18Q9UMW8 372 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.35■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 TNFRSF10BO14763 440 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ATG13O75143 517 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF202O95125 648 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 HLA-DRAP01903 254 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 RETP07949 1114 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NR2F2P24468 414 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ASPAP45381 313 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 VAMP7P51809 220 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SPEM2Q0P670 501 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NFIL3Q16649 462 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 TAF4BQ92750 862 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FBXO32Q969P5 355 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 IL37Q9NZH6 218 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.34■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 ATP8B3O60423 1300 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 MAPK13O15264 365 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 AP1G2O75843 785 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 KIF20AO95235 890 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NFATC1O95644 943 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 TRIM49P0CI25 452 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 TRIM49CP0CI26 452 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 P4HA1P13674 534 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC130P13994 396 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NDST1P52848 882 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SLC5A3P53794 718 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 PPP3CAQ08209 521 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 NR1H3Q13133 447 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 GAB4Q2WGN9 574 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FBXO43Q4G163 708 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 EXOC4Q96A65 974 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 SMOQ99835 787 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 KRT82Q9NSB4 513 aa20.33■□□□□ 0.85
PITRM1-211ENST00000490510 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PITRM1-211ENST00000490510 BEST1O76090 585 aa20.32■□□□□ 0.84
PITRM1-211ENST00000490510 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PITRM1-211ENST00000490510 OPRD1P41143 372 aa20.32■□□□□ 0.84
PITRM1-211ENST00000490510 PIK3CAP42336 1068 aa20.32■□□□□ 0.84
PITRM1-211ENST00000490510 GCLMP48507 274 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms