RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490104.5

TSN-208, Transcript of translin, humanhuman

TSL 2

Gene TSN, Length 2,717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSN-208ENST00000490104 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 UQCRHP07919 91 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 PDGFRAP16234 1089 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 SLC8A3P57103 927 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 DUSP4Q13115 394 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 TEX35Q5T0J7 233 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 ZNF558Q96NG5 402 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 DSEQ9UL01 958 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 SCINQ9Y6U3 715 aa14.65□□□□□ -0.06
TSN-208ENST00000490104 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 E7ENQ6 273 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 MTMR3Q13615 1198 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 CCDC181Q5TID7 509 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 CREG2Q8IUH2 290 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ZBTB9Q96C00 473 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.65□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 STILQ15468 1287 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ZNF280DQ6N043 979 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 FAM171BQ6P995 826 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 VPS52Q8N1B4 723 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 GIPC2Q8TF65 315 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PKMYT1Q99640 499 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ABCB6Q9NP58 842 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 VCANP13611 3396 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PROSCO94903 275 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PYGMP11217 842 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 TYMPP19971 482 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PLCB3Q01970 1234 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ADCY1Q08828 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 DCAF6Q58WW2 860 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.079e-7■■■□□ 16.9
TSN-208ENST00000490104 HES6Q96HZ4 224 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 LTBP2Q14767 1821 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 OAZ2O95190 189 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 FGFR3P22607 806 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PSMD5Q16401 504 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 TMEM110Q86TL2 294 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 NR2E1Q9Y466 385 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 WDR27A2RRH5 827 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SETSIPP0DME0 302 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 IL1R2P27930 398 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 PLA2G4AP47712 749 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 USP46P62068 366 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SLC6A3Q01959 620 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 KAZNQ674X7 775 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 FIBCD1Q8N539 461 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 HSPH1Q92598 858 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.63□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 VNN2O95498 520 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 FGGP02679 453 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 GABRB2P47870 512 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 NME3Q13232 169 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 USP41Q3LFD5 358 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 TTC16Q8NEE8 873 aa14.62□□□□□ -0.07
TSN-208ENST00000490104 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms