RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 BCAT1P54687 386 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC12A2P55011 1212 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM32Q13049 653 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 HIF1AQ16665 826 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 OVOS1Q6IE37 1185 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 RAPH1Q70E73 1250 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 VPS52Q8N1B4 723 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 DCLK2Q8N568 766 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CPXM1Q96SM3 734 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ZIC5Q96T25 663 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 FZD8Q9H461 694 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 IRAK4Q9NWZ3 460 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TJP2Q9UDY2 1190 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PPME1Q9Y570 386 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PPEF2O14830 753 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CA12O43570 354 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 HCRTO43612 131 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 BAG2O95816 211 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPN20Q4JDL3 420 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TFDP3Q5H9I0 405 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ILDR2Q71H61 639 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 GBP5Q96PP8 586 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PADI3Q9ULW8 664 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 MYO7AQ13402 2215 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 USP17L7P0C7H9 530 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 IRF1P10914 325 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 BRAFP15056 766 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 MMRN1Q13201 1228 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TAF5Q15542 800 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CFAP157Q5JU67 520 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SPATA24Q86W54 205 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB106AQ8N104 65 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 MDM1Q8TC05 714 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 GPR152Q8TDT2 470 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 APOL2Q9BQE5 337 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CNPY3Q9BT09 278 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SUFUQ9UMX1 484 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 H3BRJ5 948 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PFDN1O60925 122 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ODC1P11926 461 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 NUGGCQ68CJ6 796 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR93Q6P2C0 686 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PCGF5Q86SE9 256 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 RAPGEF5Q92565 580 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 B4GALT4O60513 344 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 LSM8O95777 96 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PRPSAP1Q14558 356 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 BOLA3Q53S33 107 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC31Q6UY01 552 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 PIGZQ86VD9 579 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SPDL1Q96EA4 605 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 SCYL1Q96KG9 808 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 RILPQ96NA2 401 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 MYH8P13535 1937 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 KPNA6O60684 536 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 LMO2P25791 158 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDH3A1P30838 453 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 GRB14Q14449 540 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRVP-201ENST00000482597 CST9Q5W186 159 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms