RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 MAPK13O15264 365 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 OGTO15294 1046 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 P4HA2O15460 535 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 XYLBO75191 536 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 NFICP08651 508 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CLTAP09496 248 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CEBPBP17676 345 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ELF1P32519 619 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 KCNA1Q09470 495 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CETN1Q12798 172 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 HTR4Q13639 388 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SLC18A3Q16572 532 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ZPBP2Q6X784 338 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GPR65Q8IYL9 337 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GPR152Q8TDT2 470 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FGF13Q92913 245 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 HVCN1Q96D96 273 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SUSD3Q96L08 255 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FIZ1Q96SL8 496 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CORO1BQ9BR76 489 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 COL4A2P08572 1712 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ZNF292O60281 2723 aa6.66□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 H0YCG3 227 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 H7C4K7 107 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FAM189A1O60320 539 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SOAT2O75908 522 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 AKAP3O75969 853 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 NOL4O94818 638 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 LRG1P02750 347 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 RHOP08100 348 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CPB1P15086 417 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 UCHL3P15374 230 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FERP16591 822 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GJA1P17302 382 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SCP2P22307 547 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PRKCIP41743 596 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PAFAH1B1P43034 410 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CASP5P51878 434 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 WNT7BP56706 349 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SH3BP2P78314 561 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CBX1P83916 185 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GTF2BQ00403 316 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ADCY1Q08828 1119 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 HGSNATQ68CP4 663 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 DESI1Q6ICB0 168 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 WDR93Q6P2C0 686 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SAAL1Q96ER3 474 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 TMEM209Q96SK2 561 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FOXQ1Q9C009 403 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 GANQ9H2C0 597 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CDH7Q9ULB5 785 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 INTUQ9ULD6 942 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.65□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 A0A0B4J269 797 aa6.65□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 A0A0U1RQJ8 604 aa6.65□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.65□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 ANHXE9PGG2 379 aa6.65□□□□□ -1.35
MITF-215ENST00000478490 SYN3O14994 580 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms