RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474266.1

RPS6KA3-204, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, human

TSL 3

Gene RPS6KA3, Length 930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA3-204	ENST00000474266	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ACD	Q96AP0	544 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SNX25	Q9H3E2	840 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CDH9	Q9ULB4	789 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RHOBTB1	O94844	696 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NFATC1	O95644	943 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MAGEA11	P43364	429 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CYP2J2	P51589	502 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ASIC1	P78348	528 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CUL4A	Q13619	759 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SLC39A14	Q15043	492 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FAM171B	Q6P995	826 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SYT13	Q7L8C5	426 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DHX58	Q96C10	678 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PCED1B	Q96HM7	432 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	GCNT4	Q9P109	453 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TCHH	Q07283	1943 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266		F8VP50	259 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	LEFTY2	O00292	366 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CLIC2	O15247	247 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	AKAP3	O75969	853 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CAVIN2	O95810	425 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PDE6C	P51160	858 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TNNC1	P63316	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SURF1	Q15526	300 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	VSTM1	Q6UX27	236 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DPH6	Q7L8W6	267 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	EDEM2	Q9BV94	578 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CPQ	Q9Y646	472 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	C4orf47	A7E2U8	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PHACTR2	O75167	634 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZXDB	P98169	803 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TRPC3	Q13507	836 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	WDR49	Q8IV35	697 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266		A8MXQ7	604 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CLDN5	O00501	218 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	SPTLC2	O15270	562 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	STX6	O43752	255 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CYP17A1	P05093	508 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	CD46	P15529	392 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	OPRD1	P41143	372 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	LIMK1	P53667	647 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA3-204	ENST00000474266	AMPD3	Q01432	767 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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