RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SDCCAG3-208	ENST00000466579	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARNTL	O00327	626 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579		O00370	1275 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRAMEF12	O95522	483 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PSMC3	P17980	439 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	YWHAQ	P27348	245 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ADORA2B	P29275	332 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VIPR2	P41587	438 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TUB	P50607	506 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIF11	P52732	1056 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TAF10	Q12962	218 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KRT31	Q15323	416 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STIL	Q15468	1287 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MEA1	Q16626	185 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SGO2	Q562F6	1265 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TXNDC8	Q6A555	127 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VIT	Q6UXI7	678 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SHC3	Q92529	594 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCML2	Q9UQR0	700 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BECN2	A8MW95	431 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDE6C	P51160	858 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BCAT1	P54687	386 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MFAP3	P55082	362 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPC5	P78333	572 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC7A9	P82251	487 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PFKP	Q01813	784 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	APBA1	Q02410	837 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CNGA2	Q16280	664 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TDP1	Q9NUW8	608 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C2orf78	A6NCI8	922 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CHAD	O15335	359 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CAVIN2	O95810	425 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SETSIP	P0DME0	302 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RFX1	P22670	979 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AVPR1A	P37288	418 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLA2G4A	P47712	749 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PGF	P49763	221 aa		10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms