RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	AREL1	O15033	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	NR2F6	P10588	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	KCNA3	P22001	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PLA2G5	P39877	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TEC	P42680	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SOX10	P56693	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	NELL1	Q92832	810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RFK	Q969G6	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TCEA3	O75764	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	NUDT3	O95989	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CSF1R	P07333	972 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	BMP5	P22003	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ACVR2A	P27037	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HSPA7	P48741	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	UROC1	Q96N76	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TIMP4	Q99727	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	LINC00473	A8K010	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PDHA1	P08559	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	IL1R1	P14778	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFB7	P17568	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	IL1R2	P27930	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CPT1A	P50416	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CCNI	Q14094	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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