RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ITGAVP06756 1048 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KRT7P08729 469 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CD48P09326 243 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KRT10P13645 584 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP5P24588 427 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PSMA2P25787 234 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 LMO2P25791 158 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MIPP30301 263 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CHKAP35790 457 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PNPLA4P41247 253 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PSMC4P43686 418 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FLT3LGP49771 235 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PMS2P54278 862 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 LILRA4P59901 499 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CAV1Q03135 178 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PRKCZQ05513 592 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 ADCY1Q08828 1119 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TAF5Q15542 800 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC14Q49A88 953 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GLRA4Q5JXX5 417 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF618Q5T7W0 954 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DCUN1D2Q6PH85 259 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC31Q6UY01 552 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 ACOT1Q86TX2 421 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC105Q8IYK2 499 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM76AQ8TAV0 307 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TEKT4Q8WW24 435 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 NT5C3BQ969T7 300 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB9Q96C00 473 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RTP4Q96DX8 246 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SNF8Q96H20 258 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 LRCH3Q96II8 777 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 SCLT1Q96NL6 688 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PKMYT1Q99640 499 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 MIOSQ9NXC5 875 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 USTQ9Y2C2 406 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CEP83Q9Y592 693 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SNX9Q9Y5X1 595 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 E7ESA3 106 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 MGEA5O60502 916 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TJP3O95049 919 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GAS8O95995 478 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 PGK1P00558 417 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 APOC2P02655 101 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CYP11A1P05108 521 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD2P08910 425 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GPD1P21695 349 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ACTN2P35609 894 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA6P43360 314 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TAF6P49848 677 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 IRAK1P51617 712 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ITGA8P53708 1063 aa5.92□□□□□ -1.46
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