RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 STIM1Q13586 685 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GJB7Q6PEY0 223 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC93AQ86WB7 457 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MED10Q9BTT4 135 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HPS4Q9NQG7 708 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CISHQ9NSE2 258 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 OSER1Q9NX31 292 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 BICDL2A1A5D9 508 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM66O15016 1216 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PMM2O15305 246 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CLSTN1O94985 981 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 P4HA1P13674 534 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ARSAP15289 507 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 AOC1P19801 751 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R2P41236 205 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCN5P51795 746 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A3P53794 718 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CUL2Q13617 745 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF77Q15935 545 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF12Q16514 161 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 RRAGAQ7L523 313 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MON1AQ86VX9 555 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC30AQ86WT1 665 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP93Q8N1F7 819 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TFAP2BQ92481 460 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TNIP3Q96KP6 325 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR88Q9GZN0 384 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 BRD9Q9H8M2 597 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NMUR1Q9HB89 426 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GKN1Q9NS71 199 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT82Q9NSB4 513 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM92AA1XBS5 289 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y858 1186 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF263O14978 683 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CHADO15335 359 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF19O95750 216 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TBX18O95935 607 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A1P19634 815 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNMA1Q12791 1236 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS6Q14393 721 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GAB4Q2WGN9 574 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MIIPQ5JXC2 388 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SCD5Q86SK9 330 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms