RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443679.1

LINC00345-201, long intergenic non-protein coding RNA 345, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00345, Length 285 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00345-201ENST00000443679 NEXNQ0ZGT2 675 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 LRMPQ12912 555 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SEMA3BQ13214 749 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MTA1Q13330 715 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ITGADQ13349 1161 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 FOXE3Q13461 319 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MTM1Q13496 603 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SLC12A1Q13621 1099 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DYRK1AQ13627 763 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PMS2P11Q13670 270 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CCNIQ14094 377 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DAG1Q14118 895 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ARHGEF7Q14155 803 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PLS1Q14651 629 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ICAM4Q14773 271 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 KIF22Q14807 665 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MFSD13AQ14CX5 517 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 VEPH1Q14D04 833 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PDCD1Q15116 288 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PLCB4Q15147 1175 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ANKRD1Q15327 319 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 GPR68Q15743 365 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CNGA2Q16280 664 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 GPR162Q16538 588 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TBR1Q16650 682 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TIGD6Q17RP2 521 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 BMT2Q1RMZ1 405 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ARL13BQ3SXY8 428 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 GXYLT1Q4G148 440 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CCDC38Q502W7 563 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ASPRV1Q53RT3 343 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PRR16Q569H4 304 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CRB2Q5IJ48 1285 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 NOMO2Q5JPE7 1267 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 C3orf38Q5JPI3 329 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 METTL24Q5JXM2 366 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PRR31Q5SQ13 230 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MFSD14BQ5SR56 506 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DACT2Q5SW24 774 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 WDR78Q5VTH9 848 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 AGAP9Q5VTM2 703 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DCAF12L1Q5VU92 463 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 FAM171A1Q5VUB5 890 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 RRAGBQ5VZM2 374 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SLC9A4Q6AI14 798 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TRIM68Q6AZZ1 485 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 NXNQ6DKJ4 435 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TTLL5Q6EMB2 1281 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CES5AQ6NT32 575 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MRNIPQ6NTE8 343 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 RINT1Q6NUQ1 792 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TAF2Q6P1X5 1199 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 WDR93Q6P2C0 686 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 GGT6Q6P531 493 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 ANKRD16Q6P6B7 361 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TMEM154Q6P9G4 183 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SYCE2Q6PIF2 218 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 USP17L6PQ6QN14 398 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SHC4Q6S5L8 630 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MTHFD1LQ6UB35 978 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CRTC1Q6UUV9 634 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 KIRREL2Q6UWL6 708 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 NPNTQ6UXI9 565 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CLEC9AQ6UXN8 241 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 NFXL1Q6ZNB6 911 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 Q6ZNX1 250 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 DCDC5Q6ZRR9 648 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 LCNL1Q6ZST4 164 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 SEM1Q6ZVN7 128 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 TTLL10Q6ZVT0 673 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PTCHD4Q6ZW05 846 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 UNC13DQ70J99 1090 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 MAEAQ7L5Y9 396 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 RAB11FIP2Q7L804 512 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa0.5□□□□□ -2.33
LINC00345-201ENST00000443679 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms