RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ATP8B3O60423 1300 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CETN3O15182 167 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SMC2O95347 1197 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 P4HA1P13674 534 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MXI1P50539 228 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SLC5A3P53794 718 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SATB1Q01826 763 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ADSSL1Q8N142 457 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 WHAMMQ8TF30 809 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TIGD1Q96MW7 591 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SMOQ99835 787 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ARID3AQ99856 593 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 RNF38Q9H0F5 515 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 FRYLO94915 3013 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 BIN1O00499 593 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF10BO14763 440 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 IFNAR2P48551 515 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MAP3K7CLP57077 242 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CBWD6Q4V339 395 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZNF394Q53GI3 561 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 KRT39Q6A163 491 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 NUP93Q8N1F7 819 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 FBXO32Q969P5 355 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MSANTD3Q96H12 275 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TSG101Q99816 390 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CPQQ9Y646 472 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SOBPA7XYQ1 873 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 LEFTY2O00292 366 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 KINO60870 393 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TDGF1P13385 188 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 BMP6P22004 513 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 YWHAQP27348 245 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 GJA4P35212 333 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 PGFP49763 221 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 DMWDQ09019 674 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 INCA1Q0VD86 236 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CCINQ13939 588 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 LRRC32Q14392 662 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 EML3Q32P44 896 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 UNC93AQ86WB7 457 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 TATDN2Q93075 761 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 GMIPQ9P107 970 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CEP250Q9BV73 2442 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CILPO75339 1184 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 OLFM2O95897 454 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 EGFP01133 1207 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 PDGFRLQ15198 375 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ECT2Q9H8V3 914 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 RAB20Q9NX57 234 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 EHD2Q9NZN4 543 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 ANTXRLA6NF34 631 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 COCHO43405 550 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 GTF2H1P32780 548 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 CXCL12P48061 93 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-209ENST00000439106 GALK1P51570 392 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms