RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 LGALS2P05162 132 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MSH2P43246 934 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 GAD2Q05329 585 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MGAT5Q09328 741 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CBLBQ13191 982 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAJC3Q13217 504 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SETDB1Q15047 1291 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TAF5Q15542 800 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ILDR2Q71H61 639 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PAFAH2Q99487 392 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP5HO75947 161 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM63AO94886 807 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CCNB1P14635 433 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC1A5Q15758 541 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 BBS9Q3SYG4 887 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 UBA3Q8TBC4 463 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 AKT3Q9Y243 479 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT4P19013 534 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ALDH3A1P30838 453 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 NDST1P52848 882 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CDH6P55285 790 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MOGSQ13724 837 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PDK2Q15119 407 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ASRGL1Q7L266 308 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CPB2Q96IY4 423 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PEBP4Q96S96 227 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DPP3Q9NY33 737 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PNMA3Q9UL41 463 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PRPSAP2O60256 369 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PDGFRAP16234 1089 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ACAP3Q96P50 834 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CYTH2Q99418 400 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 EVPLQ92817 2033 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DPYSL4O14531 572 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TM9SF1O15321 606 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SPAG6O75602 509 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNJ2P63252 427 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ARMCX2Q7L311 632 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DCAKDQ8WVC6 231 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 USP6NLQ92738 828 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 GRID1Q9ULK0 1009 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DCTN3O75935 186 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 BOLA3Q53S33 107 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MZB1Q8WU39 189 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MCM3APO60318 1980 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CHADO15335 359 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.455e-7■■■■□ 25.4
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 VSIG1Q86XK7 387 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 AFG1LQ8WV93 481 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF157Q96PX1 679 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CFAP69A5D8W1 941 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 UNC5CO95185 931 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ALADP13716 330 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP3A5P20815 502 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT81Q14533 505 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC125Q86Z20 511 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PPTC7Q8NI37 304 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TEKT4Q8WW24 435 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 VTA1Q9NP79 307 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PAK5Q9P286 719 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 E5RJQ4 531 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SETSIPP0DME0 302 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DESP17661 470 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TGM2P21980 687 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MMRN1Q13201 1228 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms