RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 ACCSQ96QU6 501 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 GINM1Q9NU53 330 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 FAM153AQ9UHL3 310 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 RTTNQ86VV8 2226 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 RAD23AP54725 363 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 CCL15Q16663 113 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 C5orf22Q49AR2 442 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 TRIM73Q86UV7 250 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 CHSY1Q86X52 802 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 MTFR1LQ9H019 292 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 STUB1Q9UNE7 303 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 MAPK1P28482 360 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 EPHB1P54762 984 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 PLD3Q8IV08 490 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 USP17L15C9J2P7 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 USP17L10C9JJH3 530 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 USP17L11C9JVI0 530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 USP17L18D6R9N7 530 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 USP17L19D6RCP7 530 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 GSTA4O15217 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 NCAM2O15394 837 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 VNN2O95498 520 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 BCL10O95999 233 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 CDC16Q13042 620 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 ADAM9Q13443 819 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.63e-12■■■■■ 70.5
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PTPRD-203ENST00000381196 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 FEM1BQ9UK73 627 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 CHRNA5P30532 468 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 STX12Q86Y82 276 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-203ENST00000381196 HDAC11Q96DB2 347 aa5.05□□□□□ -1.6
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