RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.26■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SHC3Q92529 594 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EDAQ92838 391 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO32Q969P5 355 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.26■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRR33A8MZF0 331 aa16.25■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 UCHL3P15374 230 aa16.24■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.24■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINC1P01008 464 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CKMP06732 381 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMC3P17980 439 aa16.23■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SYCP1Q15431 976 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MEA1Q16626 185 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 LUZP1Q86V48 1076 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGZQ86VD9 579 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 NEK11Q8NG66 645 aa16.23■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 STK33Q9BYT3 514 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPY26PQ9H489 355 aa16.23■□□□□ 0.19
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PGGT1B-202ENST00000379615 TDP1Q9NUW8 608 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 F5P12259 2224 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 HHLA1C9JL84 531 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QYV0 167 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 THAP12O43422 761 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TADA3O75528 432 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 FCARP24071 287 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 VIPR2P41587 438 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G4AP47712 749 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PSEN1P49768 467 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBP50607 506 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF11P52732 1056 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE4CQ08493 712 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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