RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PLAAQ9Y263 795 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GTH6 734 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 EML1O00423 815 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RAMP2O60895 175 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 NNTQ13423 1086 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MORF4L2Q15014 288 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FSCBQ5H9T9 825 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SERPINI1Q99574 410 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 BRD9Q9H8M2 597 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RRN3Q9NYV6 651 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CSH1P0DML2 217 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CSH2P0DML3 217 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GRIK3Q13003 919 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 LBX2Q6XYB7 198 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MAML3Q96JK9 1138 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 Q9H521 79 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 NT5MQ9NPB1 228 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RPTORQ8N122 1335 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 IGSF6O95976 241 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PON1P27169 355 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 THOP1P52888 689 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FPGSQ05932 587 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 WSCD1Q658N2 575 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 C4orf22Q6V702 233 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RRM2BQ7LG56 351 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PNMA5Q96PV4 448 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ATRNO75882 1429 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CTSEP14091 401 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 KLK7P49862 253 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RAP1GDS1P52306 607 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PDCLQ13371 301 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 HECTD3Q5T447 861 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ALS2CLQ60I27 953 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 EMBQ6PCB8 327 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 A0A0G2JND7 137 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FZD9O00144 591 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC130P13994 396 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CYP11B1P15538 503 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SESN3P58005 492 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ACOX1Q15067 660 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PDK2Q15119 407 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 C2CD6Q53TS8 623 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 CCL5P13501 91 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 SYN1P17600 705 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 GLUD2P49448 558 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 BTBD7Q9P203 1132 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 SPATA31D3P0C874 917 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 MYBPC2Q14324 1141 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRK-205ENST00000368213 PIK3CDO00329 1044 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms