RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 TTC27Q6P3X3 843 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAM171BQ6P995 826 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAM35AQ86V20 835 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 EXD1Q8NHP7 514 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MYLPFQ96A32 169 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 HSFY1Q96LI6 401 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 OR4Q2P0C623 313 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAM200BP0CF97 657 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ1P48048 391 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 KAZNQ674X7 775 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 B3GALT6Q96L58 329 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PEBP4Q96S96 227 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PKMYT1Q99640 499 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.12■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 KRT1P04264 644 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 BDNFP23560 247 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ADCY1Q08828 1119 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SNX1Q13596 522 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC38Q5VT99 294 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 IFT81Q8WYA0 676 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB9Q96C00 473 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CNPY3Q9BT09 278 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GDF3Q9NR23 364 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 DSEQ9UL01 958 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.11■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 RNF8O76064 485 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH2P05091 517 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CLTBP09497 229 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ACADSBP45954 432 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SLC11A1P49279 550 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SNX16P57768 344 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PLVAPQ9BX97 442 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CYLDQ9NQC7 956 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CHST7Q9NS84 486 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 USP18Q9UMW8 372 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRDP23468 1912 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 HHLA1C9JL84 531 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PHF2O75151 1096 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CD48P09326 243 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TYMPP19971 482 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PTGIRP43119 386 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TKTL1P51854 596 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SLC8A3P57103 927 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 CEP57Q86XR8 500 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 HSPH1Q92598 858 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.1■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 LRRD1A4D1F6 860 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 SASH3O75995 380 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 TUBBP07437 444 aa16.09■□□□□ 0.17
CASQ1-201ENST00000368078 PAX3P23760 479 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms