RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SELLP14151 372 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NID1P14543 1247 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GRK5P34947 590 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GPC3P51654 580 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A1P53985 500 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 POLE2P56282 527 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RPS16P62249 146 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MXRA7P84157 204 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CDC42EP1Q00587 391 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CUL4BQ13620 913 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EEF1DP3Q658K8 133 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RPAINQ86UA6 219 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TASP1Q9H6P5 420 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD8Q9NX08 183 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CA14Q9ULX7 337 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ASB1Q9Y576 335 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 IRS2Q9Y4H2 1338 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQJ5 194 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PR48 441 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 DLL1O00548 723 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SPTLC2O15270 562 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 DYRK3O43781 588 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC175P0C221 793 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ALADP13716 330 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5DP30049 168 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 HADHAP40939 763 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4A11Q02928 519 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GRM1Q13255 1194 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GAS6Q14393 721 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 IRF3Q14653 427 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NPY5RQ15761 445 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SLC5A9Q2M3M2 681 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NUTM2GQ5VZR2 741 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GAREM2Q75VX8 874 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KDELC2Q7Z4H8 507 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 HSCBQ8IWL3 235 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 OR8H3Q8N146 312 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PIBF1Q8WXW3 757 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 IWS1Q96ST2 819 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LACRTQ9GZZ8 138 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TBCCD1Q9NVR7 557 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP45Q9UL16 551 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EDARQ9UNE0 448 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KIF3AQ9Y496 699 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TNRQ92752 1358 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PLXNB2O15031 1838 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WWL8 130 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 OPHN1O60890 802 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ACADMP11310 421 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GUCY1A2P33402 732 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ST5P78524 1137 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 POU4F1Q01851 419 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NFIXQ14938 502 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PPA1Q15181 289 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 STILQ15468 1287 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LETMD1Q6P1Q0 360 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT8Q92599 483 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KCNN1Q92952 543 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 UIMC1Q96RL1 719 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SDF4Q9BRK5 362 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GPR63Q9BZJ6 419 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF287Q9HBT7 754 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FAM105AQ9NUU6 356 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TBX20Q9UMR3 447 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CPDO75976 1380 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MYPNQ86TC9 1320 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FRYLO94915 3013 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 H3BM21 787 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PFDN1O60925 122 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PIAS2O75928 621 aa2.72□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 AMY1AP04745 511 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms