RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 STK32AQ8WU08 396 aa11.66□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 TNIP3Q96KP6 325 aa11.66□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 STIM2Q9P246 746 aa11.66□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 FSCN2O14926 492 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 SART1O43290 800 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 LSP1P33241 339 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.65□□□□□ -0.54
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ABCD4-201ENST00000356924 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 PRELID2Q8N945 189 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 GDF3Q9NR23 364 aa11.65□□□□□ -0.54
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ABCD4-201ENST00000356924 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 PSMA2P25787 234 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 BRCC3P46736 316 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 BCAT1P54687 386 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 TTMPQ5BVD1 217 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 FUKQ8N0W3 1084 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 UROC1Q96N76 676 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.65□□□□□ -0.54
ABCD4-201ENST00000356924 I3L4J1 428 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CLDN5O00501 218 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PITPNM1O00562 1244 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ENPP3O14638 875 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DDHD2O94830 711 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RARAP10276 462 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 HSPA6P17066 643 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TNFRSF8P28908 595 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 LRRC38Q5VT99 294 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DBF4BQ8NFT6 615 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 GGA2Q9UJY4 613 aa11.65□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 F8W810 466 aa11.64□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 LHX1P48742 406 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 EPHB4P54760 987 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DSC1Q08554 894 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 NNTQ13423 1086 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 NAA25Q14CX7 972 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CYP1B1Q16678 543 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MIS12Q9H081 205 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 AMACRQ9UHK6 382 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 M0QZQ0 153 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PHF2O75151 1096 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 B3GAT3O94766 335 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CYP11A1P05108 521 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SLC8A1P32418 973 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 GJC1P36383 396 aa11.64□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 SLC6A3Q01959 620 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 LLGL1Q15334 1064 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 KCTD16Q68DU8 428 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 EMBQ6PCB8 327 aa11.64□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SYT15Q9BQS2 421 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CYLDQ9NQC7 956 aa11.64□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 LRCH4O75427 683 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 BEST1O76090 585 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 IL1R2P27930 398 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TAF5Q15542 800 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TTC27Q6P3X3 843 aa11.63□□□□□ -0.55
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