RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 AGAP9Q5VTM2 703 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 ICE2Q659A1 982 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 FICDQ9BVA6 458 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 PPCSQ9HAB8 311 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF614Q8N883 585 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 OPTNQ96CV9 577 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.15■■□□□ 1.3
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PTPRM-201ENST00000332175 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 KIAA2013Q8IYS2 634 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.13■■□□□ 1.29
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