RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 LCHNA4D1U4 455 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 F8VP50 259 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MAN1A1P33908 653 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 DNA2P51530 1060 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TKTL1P51854 596 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBB2AQ13885 445 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB41Q5JT25 222 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP290O15078 2479 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 HHLA1C9JL84 531 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO21O94952 628 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PRLRP16471 622 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEA11P43364 429 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TNS4Q8IZW8 715 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC23Q9UJX2 597 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.78■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR11A4FU01 709 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM66O15016 1216 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RABGGTBP53611 331 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 OGDHQ02218 1023 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 EMC1Q8N766 993 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMB7Q99436 277 aa21.77■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GRAP2O75791 330 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMA2P25787 234 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ROR1Q01973 937 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCY1Q08828 1119 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ARCQ7LC44 396 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR65Q8IYL9 337 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GPD1P21695 349 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 OR1D2P34982 312 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNNB1P35222 781 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF5Q15542 800 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CD101Q93033 1021 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 C8orf48Q96LL4 319 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.76■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR27A2RRH5 827 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC66A2RUB6 948 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNK3O14649 394 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM12O43184 909 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 HSF2BPO75031 334 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SRGAP2O75044 1071 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJB2P25686 324 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 FLT3P36888 993 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFV1P49821 464 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CREMQ03060 361 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SHHQ15465 462 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 USTQ9Y2C2 406 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01553A4QN01 128 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PDGFRAP16234 1089 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCR5P32302 372 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 BMPR1AP36894 532 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBP1Q9H171 429 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBED1O96006 694 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GLI1P08151 1106 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L7P0C7H9 530 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DESP17661 470 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNNA2P26232 953 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC5A3P53794 718 aa21.73■■□□□ 1.07
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