RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 HEY2Q9UBP5 337 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 A0A0B4J269 797 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CYP11B1P15538 503 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KRT4P19013 534 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GSTT1P30711 240 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PSMC4P43686 418 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 WDR72Q3MJ13 1102 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 RELL1Q8IUW5 271 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MINDY3Q9H8M7 445 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ZWILCHQ9H900 591 aa16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ADCY6O43306 1168 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MSCO60682 206 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 BANF1O75531 89 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ABHD2P08910 425 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 AMPD1P23109 780 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MAN1A1P33908 653 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 OSTNP61366 133 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 AP1B1Q10567 949 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GSTA5Q7RTV2 222 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GBP5Q96PP8 586 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 FNBP1Q96RU3 617 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 H0YCG3 227 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 HAUS5O94927 633 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 IQCF3P0C7M6 154 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ETS1P14921 441 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GJC1P36383 396 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GPC3P51654 580 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 NR1H3Q13133 447 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 FYB2Q5VWT5 728 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SESTD1Q86VW0 696 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC89Q8N998 374 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PTPRN2Q92932 1015 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM167AQ96KS9 214 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KATNBL1Q9H079 304 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SYNCQ9H7C4 482 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PHF24Q9UPV7 400 aa15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 VNN1O95497 513 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 LGALS2P05162 132 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 INSRRP14616 1297 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KLRC2P26717 231 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SERPINB3P29508 390 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CETN2P41208 172 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 HUNKP57058 714 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 IER5Q5VY09 327 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 TTC7BQ86TV6 843 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 VPS52Q8N1B4 723 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 STMN2Q93045 179 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 GOLGA8RI6L899 631 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MAP3K7O43318 606 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KRT5P13647 590 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CPA2P48052 419 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PSMD6Q15008 389 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 NT5C1BQ96P26 610 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 NDNQ99608 321 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 PIGRP01833 764 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 HLA-DRAP01903 254 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 LYNP07948 512 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SMPD1P17405 629 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SCNN1BP51168 640 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC18A1P54219 525 aa15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRRTM1-201ENST00000295057 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms