RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294172.6

NXF1-201, Transcript of nuclear RNA export factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXF1, Length 2,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1-201ENST00000294172 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 SPATA18Q8TC71 538 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 CCDC77Q9BR77 488 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 RSAD1Q9HA92 442 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 KPNA7A9QM74 516 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 MCF2LO15068 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 CD4P01730 458 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 APOC2P02655 101 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 FGFR1P11362 822 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 CREB1P16220 341 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 SDC4P31431 198 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 RGS2P41220 211 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 IFNAR2P48551 515 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 SLC6A3Q01959 620 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 UBXN11Q5T124 520 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 RELL1Q8IUW5 271 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 MGARPQ8TDB4 240 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 CENPTQ96BT3 561 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 SNX25Q9H3E2 840 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.65□□□□□ -0.06
NXF1-201ENST00000294172 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 PIRO00625 290 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ATP5DP30049 168 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TMEM110Q86TL2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 UNC93AQ86WB7 457 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CYP4X1Q8N118 509 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 USP6NLQ92738 828 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 IPPQ9Y573 584 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CEP350Q5VT06 3117 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 BANF1O75531 89 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 GABBR2O75899 941 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 RBP3P10745 1247 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 LCP1P13796 627 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 NRLP54845 237 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 GAD2Q05329 585 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 MTM1Q13496 603 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 DPYSL3Q14195 570 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 LRRC14Q15048 493 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 C17orf99Q6UX52 265 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CENPUQ71F23 418 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.64□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 SETSIPP0DME0 302 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TAF6P49848 677 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ADCY1Q08828 1119 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 IRF5Q13568 498 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 STAT4Q14765 748 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 APPL2Q8NEU8 664 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 P3H4Q92791 437 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 ZNF560Q96MR9 790 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TMEM120BA0PK00 339 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 MYADML2A6NDP7 307 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 CDH16O75309 829 aa14.63□□□□□ -0.07
NXF1-201ENST00000294172 TCEA3O75764 348 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms